桐城有四大河流水系：分别是大沙河、挂车河、龙眠河、孔城河。
1、桐城大沙河位于安徽省境内，是皖江的一部分。大沙河发源于大别山南麓岳西县巍岭乡丛毛尖，海拔高程1465m，流经潜山县黄柏山区至沙河埠出山口，至尖刀咀分为柏年河和人行河，至乌鱼宕又汇合，经赌其墩入菜子湖。大沙河也是每年雨季来临时极易发生水灾的，因为大沙河地质条件非常特殊，河床泥沙沉淀，两岸堤坝的主要组成也是泥沙。
2、挂车河，挂车河是安徽省桐城市境内的一条重要河流。挂车河发源于大别山余脉，从牯牛背水库汇集流出，最终汇入嬉子湖。挂车河清澈见底，沿岸生态保护良好，景色优美。历史上第一次挂车河战役,太平军第一次援救安庆的会战。这条河不仅政治意义重大，也是资源保护最好的河流。
3、龙眠河位于安徽省桐城市，是桐城人的母亲河，横穿桐城市区，是桐城市一条重要的河流，沿河两岸是桐城的经济核心处，著名的龙眠桥和紫来桥横跨其上。位于龙眠桥附近龙眠河两岸现已建成龙眠河公园，公园以徽派建筑为主调，但又不乏现代气息，公园附近现已建成大面积商业街。由于现代化文明的发展，造成龙眠河水体污染严重。2008年，桐城市开始进行龙眠河综合治理。龙眠河综合整治工程是一项集河道治理、拆迁安置、城市建设、环境整治和生态改善的综合性系统工程。
4、孔城河是指桐城市孔城镇境内的一条河流，由多条支流汇同、会合而成。孔城河曾经是繁忙的航运水道，孔城镇曾经是繁华的水岸码头。
自古以来，城市的兴起与繁华都和河流的繁衍有着鱼水相依的不解之缘。许多时候，河流就是一个城市的代名词，是一座城市的魂魄，是一座城市的母亲。
“水清、岸绿、流畅”是城市河流治理的首要目标。基于种种考虑，龙南县对河流治理提出并实施了“预防与治理并举，自然与人工和谐”的思路。
2018年7月21～22日，安庆市水利局在桐城市主持召开了“柏年河三湾河上段”、“孔城河金涧左段”两段中小河流防洪工程初步设计报告审查会，省水利厅、安庆市水利局有关领导和青草、新渡、吕亭镇政府等有关代表单位专家参加了本次审查会。这两段中小河流治理项目是在2016年汛后被纳入“安徽省灾后水利薄弱环节”建设性治理内容之一，并作为民生工程纳入对地方政府的考核。其中，三湾河上段防洪工程计划总投资2900万元，综合治理河长约5km；孔城河金涧左段防洪工程计划总投资2950万元，综合治理河长5.02km。 截污清污，让桐城的城市河流由浊变清。人是河流最大的污染源。饮水当思源，城市居民饮用的自来水大多取自河流，可是许多市民并不爱惜这个“饮水池”，将之当成垃圾池、洗浴池，肆意污染河流的行为屡见不鲜。因此，只有提高市民的素质，人与河流真正相互依存、相互尊重，才能最终让城市与河流和谐共处、共生共长。
